Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Pygm-202ENSMUST00000113483 2583 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 AC133598.5-201ENSMUST00000224937 1517 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Zbtb37-201ENSMUST00000159250 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Col12a1-202ENSMUST00000121227 9953 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Pcdh9-204ENSMUST00000193901 6127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 B020031H02Rik-201ENSMUST00000209977 3673 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Adcy9-202ENSMUST00000117801 4507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Rimbp2-205ENSMUST00000199537 6966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Traf7-215ENSMUST00000176652 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Eno4-202ENSMUST00000200910 2567 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Eno4-201ENSMUST00000054280 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 AW146154-201ENSMUST00000098509 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 4930505M18Rik-201ENSMUST00000175854 1288 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Gm20641-201ENSMUST00000176069 615 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Zfp407-202ENSMUST00000125763 7906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Upp2-201ENSMUST00000059102 2498 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Sox6-201ENSMUST00000072804 8227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Plec-202ENSMUST00000054449 15018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Cd163-202ENSMUST00000112541 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Phactr1-202ENSMUST00000110161 1950 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Zfp324-201ENSMUST00000038701 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Sfi1-201ENSMUST00000066391 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Clasp1-205ENSMUST00000185405 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Retsat-201ENSMUST00000070597 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Synrg-202ENSMUST00000092834 7115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Osbpl3-203ENSMUST00000114466 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Gm28593-201ENSMUST00000190989 2170 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Gm28884-201ENSMUST00000190367 3994 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Gm37694-201ENSMUST00000191696 2133 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Rnase6-202ENSMUST00000226194 2452 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Snd1-206ENSMUST00000167201 3781 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 9530036M11Rik-201ENSMUST00000138767 1996 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Kng2-202ENSMUST00000100046 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms