Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms