Protein–RNA interactions for Protein: A2AMM0

Cavin4, Caveolae-associated protein 4, mousemouse

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Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin4A2AMM0 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cavin4A2AMM0 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cavin4A2AMM0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cavin4A2AMM0 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cavin4A2AMM0 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cavin4A2AMM0 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cavin4A2AMM0 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cavin4A2AMM0 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cavin4A2AMM0 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cavin4A2AMM0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cavin4A2AMM0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cavin4A2AMM0 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cavin4A2AMM0 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cavin4A2AMM0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cavin4A2AMM0 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cavin4A2AMM0 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cavin4A2AMM0 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cavin4A2AMM0 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cavin4A2AMM0 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cavin4A2AMM0 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cavin4A2AMM0 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cavin4A2AMM0 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cavin4A2AMM0 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cavin4A2AMM0 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cavin4A2AMM0 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cavin4A2AMM0 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cavin4A2AMM0 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cavin4A2AMM0 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cavin4A2AMM0 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cavin4A2AMM0 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cavin4A2AMM0 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cavin4A2AMM0 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cavin4A2AMM0 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cavin4A2AMM0 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cavin4A2AMM0 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cavin4A2AMM0 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cavin4A2AMM0 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cavin4A2AMM0 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cavin4A2AMM0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cavin4A2AMM0 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cavin4A2AMM0 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cavin4A2AMM0 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cavin4A2AMM0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cavin4A2AMM0 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cavin4A2AMM0 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cavin4A2AMM0 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cavin4A2AMM0 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cavin4A2AMM0 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cavin4A2AMM0 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cavin4A2AMM0 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cavin4A2AMM0 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cavin4A2AMM0 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cavin4A2AMM0 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cavin4A2AMM0 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cavin4A2AMM0 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cavin4A2AMM0 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cavin4A2AMM0 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cavin4A2AMM0 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cavin4A2AMM0 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cavin4A2AMM0 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cavin4A2AMM0 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cavin4A2AMM0 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cavin4A2AMM0 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cavin4A2AMM0 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cavin4A2AMM0 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cavin4A2AMM0 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cavin4A2AMM0 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cavin4A2AMM0 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cavin4A2AMM0 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cavin4A2AMM0 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cavin4A2AMM0 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cavin4A2AMM0 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cavin4A2AMM0 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cavin4A2AMM0 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cavin4A2AMM0 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cavin4A2AMM0 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cavin4A2AMM0 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cavin4A2AMM0 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cavin4A2AMM0 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cavin4A2AMM0 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cavin4A2AMM0 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cavin4A2AMM0 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cavin4A2AMM0 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cavin4A2AMM0 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cavin4A2AMM0 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cavin4A2AMM0 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cavin4A2AMM0 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cavin4A2AMM0 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cavin4A2AMM0 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cavin4A2AMM0 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cavin4A2AMM0 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cavin4A2AMM0 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cavin4A2AMM0 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cavin4A2AMM0 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cavin4A2AMM0 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cavin4A2AMM0 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cavin4A2AMM0 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cavin4A2AMM0 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cavin4A2AMM0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cavin4A2AMM0 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms