Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L1

Chd5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, mousemouse

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Length 1,946 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd5A2A8L1 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd5A2A8L1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd5A2A8L1 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd5A2A8L1 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd5A2A8L1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd5A2A8L1 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd5A2A8L1 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd5A2A8L1 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd5A2A8L1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd5A2A8L1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd5A2A8L1 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd5A2A8L1 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd5A2A8L1 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd5A2A8L1 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd5A2A8L1 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd5A2A8L1 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd5A2A8L1 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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