Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms