Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Vav3Q9R0C8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Vav3Q9R0C8 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vav3Q9R0C8 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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Vav3Q9R0C8 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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