Protein–RNA interactions for Protein: Q9R053

Scn11a, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, mousemouse

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Length 1,765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn11aQ9R053 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Scn11aQ9R053 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Scn11aQ9R053 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Scn11aQ9R053 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn11aQ9R053 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Scn11aQ9R053 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Scn11aQ9R053 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn11aQ9R053 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Scn11aQ9R053 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Scn11aQ9R053 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Scn11aQ9R053 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Scn11aQ9R053 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Scn11aQ9R053 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Scn11aQ9R053 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Scn11aQ9R053 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Scn11aQ9R053 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn11aQ9R053 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn11aQ9R053 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Scn11aQ9R053 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Scn11aQ9R053 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn11aQ9R053 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn11aQ9R053 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn11aQ9R053 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn11aQ9R053 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn11aQ9R053 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn11aQ9R053 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn11aQ9R053 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn11aQ9R053 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn11aQ9R053 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn11aQ9R053 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn11aQ9R053 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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