Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms