Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms