Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsmQ9JL96 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms