Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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