Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Tuba8Q9JJZ2 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Tuba8Q9JJZ2 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Tuba8Q9JJZ2 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Tuba8Q9JJZ2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Tuba8Q9JJZ2 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Tuba8Q9JJZ2 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Tuba8Q9JJZ2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Tuba8Q9JJZ2 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Tuba8Q9JJZ2 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Tuba8Q9JJZ2 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
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