Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Snx5Q9D8U8 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Snx5Q9D8U8 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx5Q9D8U8 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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