Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8N1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8N1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8N1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8N1 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8N1 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8N1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8N1 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8N1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms