Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Nop56Q9D6Z1 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Nop56Q9D6Z1 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Nop56Q9D6Z1 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Nop56Q9D6Z1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Nop56Q9D6Z1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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Nop56Q9D6Z1 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Nop56Q9D6Z1 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Nop56Q9D6Z1 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Nop56Q9D6Z1 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Nop56Q9D6Z1 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Nop56Q9D6Z1 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Nop56Q9D6Z1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Nop56Q9D6Z1 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Nop56Q9D6Z1 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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