Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms