Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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Ccdc7Q9D541 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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Ccdc7Q9D541 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Ccdc7Q9D541 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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Ccdc7Q9D541 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Ccdc7Q9D541 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Ccdc7Q9D541 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Ccdc7Q9D541 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Ccdc7Q9D541 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Ccdc7Q9D541 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Ccdc7Q9D541 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
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