Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Pramef12Q9D2F1 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Pramef12Q9D2F1 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Pramef12Q9D2F1 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Pramef12Q9D2F1 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Pramef12Q9D2F1 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Pramef12Q9D2F1 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Pramef12Q9D2F1 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Pramef12Q9D2F1 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Pramef12Q9D2F1 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Pramef12Q9D2F1 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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Pramef12Q9D2F1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramef12Q9D2F1 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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