Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms