Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Cnot11Q9CWN7 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Cnot11Q9CWN7 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Cnot11Q9CWN7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Cnot11Q9CWN7 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Cnot11Q9CWN7 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Cnot11Q9CWN7 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Cnot11Q9CWN7 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Cnot11Q9CWN7 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Cnot11Q9CWN7 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Cnot11Q9CWN7 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
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Cnot11Q9CWN7 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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