Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Pfdn1Q9CWM4 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Pfdn1Q9CWM4 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Pfdn1Q9CWM4 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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