Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed9Q99KF1 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms