Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms