Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms