Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms