Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otud6bQ8K2H2 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms