Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms