Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfibp1Q8C8U0 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfibp1Q8C8U0 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfibp1Q8C8U0 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfibp1Q8C8U0 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfibp1Q8C8U0 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfibp1Q8C8U0 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfibp1Q8C8U0 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfibp1Q8C8U0 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfibp1Q8C8U0 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfibp1Q8C8U0 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfibp1Q8C8U0 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfibp1Q8C8U0 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfibp1Q8C8U0 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfibp1Q8C8U0 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfibp1Q8C8U0 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfibp1Q8C8U0 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfibp1Q8C8U0 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfibp1Q8C8U0 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfibp1Q8C8U0 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfibp1Q8C8U0 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfibp1Q8C8U0 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfibp1Q8C8U0 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfibp1Q8C8U0 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfibp1Q8C8U0 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfibp1Q8C8U0 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfibp1Q8C8U0 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfibp1Q8C8U0 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfibp1Q8C8U0 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfibp1Q8C8U0 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfibp1Q8C8U0 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfibp1Q8C8U0 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfibp1Q8C8U0 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfibp1Q8C8U0 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfibp1Q8C8U0 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfibp1Q8C8U0 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfibp1Q8C8U0 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfibp1Q8C8U0 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfibp1Q8C8U0 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfibp1Q8C8U0 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfibp1Q8C8U0 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppfibp1Q8C8U0 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ppfibp1Q8C8U0 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ppfibp1Q8C8U0 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ppfibp1Q8C8U0 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ppfibp1Q8C8U0 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ppfibp1Q8C8U0 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms