Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubqln3Q8C5U9 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubqln3Q8C5U9 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubqln3Q8C5U9 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubqln3Q8C5U9 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubqln3Q8C5U9 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubqln3Q8C5U9 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubqln3Q8C5U9 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubqln3Q8C5U9 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubqln3Q8C5U9 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubqln3Q8C5U9 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ubqln3Q8C5U9 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubqln3Q8C5U9 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubqln3Q8C5U9 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubqln3Q8C5U9 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubqln3Q8C5U9 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubqln3Q8C5U9 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubqln3Q8C5U9 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubqln3Q8C5U9 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubqln3Q8C5U9 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubqln3Q8C5U9 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubqln3Q8C5U9 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubqln3Q8C5U9 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubqln3Q8C5U9 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubqln3Q8C5U9 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubqln3Q8C5U9 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubqln3Q8C5U9 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubqln3Q8C5U9 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubqln3Q8C5U9 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubqln3Q8C5U9 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubqln3Q8C5U9 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubqln3Q8C5U9 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubqln3Q8C5U9 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubqln3Q8C5U9 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubqln3Q8C5U9 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubqln3Q8C5U9 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ubqln3Q8C5U9 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubqln3Q8C5U9 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms