Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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FarsaQ8C0C7 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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FarsaQ8C0C7 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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FarsaQ8C0C7 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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FarsaQ8C0C7 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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FarsaQ8C0C7 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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FarsaQ8C0C7 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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FarsaQ8C0C7 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FarsaQ8C0C7 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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