Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP27

Sfr1, Swi5-dependent recombination DNA repair protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfr1Q8BP27 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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Sfr1Q8BP27 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfr1Q8BP27 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfr1Q8BP27 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfr1Q8BP27 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfr1Q8BP27 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfr1Q8BP27 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfr1Q8BP27 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfr1Q8BP27 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfr1Q8BP27 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfr1Q8BP27 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfr1Q8BP27 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfr1Q8BP27 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfr1Q8BP27 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfr1Q8BP27 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfr1Q8BP27 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfr1Q8BP27 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfr1Q8BP27 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfr1Q8BP27 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfr1Q8BP27 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfr1Q8BP27 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfr1Q8BP27 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Sfr1Q8BP27 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sfr1Q8BP27 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sfr1Q8BP27 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sfr1Q8BP27 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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Sfr1Q8BP27 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfr1Q8BP27 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfr1Q8BP27 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfr1Q8BP27 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfr1Q8BP27 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfr1Q8BP27 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfr1Q8BP27 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfr1Q8BP27 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfr1Q8BP27 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Sfr1Q8BP27 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfr1Q8BP27 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfr1Q8BP27 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfr1Q8BP27 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Sfr1Q8BP27 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Sfr1Q8BP27 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfr1Q8BP27 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfr1Q8BP27 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Sfr1Q8BP27 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfr1Q8BP27 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Sfr1Q8BP27 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Sfr1Q8BP27 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Sfr1Q8BP27 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfr1Q8BP27 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfr1Q8BP27 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfr1Q8BP27 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfr1Q8BP27 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfr1Q8BP27 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfr1Q8BP27 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfr1Q8BP27 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfr1Q8BP27 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfr1Q8BP27 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfr1Q8BP27 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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