Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Npm2Q80W85 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Npm2Q80W85 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Npm2Q80W85 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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Npm2Q80W85 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
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Npm2Q80W85 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Npm2Q80W85 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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Npm2Q80W85 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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Npm2Q80W85 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Npm2Q80W85 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Npm2Q80W85 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
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