Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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