Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnih3Q6ZWS4 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cnih3Q6ZWS4 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cnih3Q6ZWS4 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cnih3Q6ZWS4 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cnih3Q6ZWS4 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cnih3Q6ZWS4 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Cnih3Q6ZWS4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cnih3Q6ZWS4 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cnih3Q6ZWS4 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cnih3Q6ZWS4 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cnih3Q6ZWS4 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cnih3Q6ZWS4 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cnih3Q6ZWS4 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cnih3Q6ZWS4 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnih3Q6ZWS4 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnih3Q6ZWS4 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnih3Q6ZWS4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnih3Q6ZWS4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnih3Q6ZWS4 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnih3Q6ZWS4 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnih3Q6ZWS4 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnih3Q6ZWS4 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnih3Q6ZWS4 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnih3Q6ZWS4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnih3Q6ZWS4 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnih3Q6ZWS4 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnih3Q6ZWS4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnih3Q6ZWS4 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnih3Q6ZWS4 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnih3Q6ZWS4 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnih3Q6ZWS4 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnih3Q6ZWS4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnih3Q6ZWS4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnih3Q6ZWS4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnih3Q6ZWS4 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnih3Q6ZWS4 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnih3Q6ZWS4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnih3Q6ZWS4 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnih3Q6ZWS4 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnih3Q6ZWS4 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnih3Q6ZWS4 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnih3Q6ZWS4 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnih3Q6ZWS4 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnih3Q6ZWS4 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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