Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Snx13Q6PHS6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Snx13Q6PHS6 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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