Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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NipblQ6KCD5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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NipblQ6KCD5 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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NipblQ6KCD5 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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NipblQ6KCD5 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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NipblQ6KCD5 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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NipblQ6KCD5 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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NipblQ6KCD5 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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NipblQ6KCD5 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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