Protein–RNA interactions for Protein: Q61220

Nell2, Protein kinase C-binding protein NELL2, mousemouse

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Length 819 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell2Q61220 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Nell2Q61220 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Nell2Q61220 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Nell2Q61220 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Nell2Q61220 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Nell2Q61220 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Nell2Q61220 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nell2Q61220 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms