Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms