Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gpr55Q3UJF0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms