Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms