Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hace1Q3U0D9 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms