Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms