Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms