Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXB8

Colec11, Collectin-11, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec11Q3SXB8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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