Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms