Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms