Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MitfQ08874 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MitfQ08874 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MitfQ08874 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MitfQ08874 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MitfQ08874 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MitfQ08874 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms