Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.6 ms