Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms