Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Thbs2Q03350 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms